崇神天皇（238−269年）により
「もし教えに従わない者があれば兵を以て討て」（日本書紀）
と命じられ、北陸、東海、西道、丹波にそれぞれ派遣された四道将軍のうち、丹波に派遣されたのが丹波道主命で、丹波平定後、当地に出雲国より八千矛神（やちほこのかみ---大国主神）の他二神を迎え、社殿を創建したのに始まると伝えられる。（現地説明板）

磐座とは神が降臨する巨岩のことであるが、天体観測にも使われることがある。現地の説明板によると、巨岩は意図的に配置され、北に向けて切り落としたような垂直のスリットが向かい合わせにあって、スリットの方向によって常に変わらない北極星を観測し、夏至、冬至、春分、秋分を把握して稲作などの最適時期を知った、という。

天体観測の巨石群として著名なのは、岐阜県下呂市の岩屋岩陰遺跡であるが、在野の研究者によって精密な天体観測の巨石群のしくみが発表されている。これに対して、神谷磐座は単純に北極星を観測したというスリットの役目が説明されているだけである。その内容は、由緒とは無関係のように思われる。説明板に述べられた内容の出典が知りたい所である。

主だった巨石にはしめ縄が張られ数段の階段を登って巨石群の間を通って巡回することができる。随所に祠が建てられ、信仰の対象となっている。